MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome

Total Repeats: 6747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009515	CTT	2	6	13	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009515	TTC	2	6	65	70	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009515	TTC	2	6	77	82	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009515	AATTT	2	10	1729	1738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009515	TAA	2	6	1740	1745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009515	A	7	7	1795	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009515	A	7	7	1812	1818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009515	T	6	6	1819	1824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009515	GAA	2	6	1843	1848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009515	AGC	2	6	1863	1868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009515	T	6	6	1889	1894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009515	TA	4	8	1931	1938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009515	TAA	2	6	1959	1964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009515	AAAG	2	8	1977	1984	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009515	TA	3	6	1997	2002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009515	A	7	7	2005	2011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009515	A	6	6	2043	2048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009515	A	6	6	2063	2068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009515	CTTT	2	8	3158	3165	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009515	T	7	7	3172	3178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009515	TAAAAT	2	12	3336	3347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009515	TTTA	2	8	3403	3410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009515	T	7	7	3416	3422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009515	TTA	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009515	A	6	6	3508	3513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009515	TAA	2	6	3546	3551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009515	AAT	2	6	3562	3567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009515	AT	4	8	3575	3582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009515	TA	3	6	3620	3625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009515	AAT	2	6	3626	3631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009515	AT	3	6	3630	3635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009515	TTA	2	6	3662	3667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009515	ATC	2	6	3704	3709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009515	AT	4	8	3716	3723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009515	AAT	2	6	3783	3788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009515	TTA	2	6	3809	3814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009515	ATTTT	2	10	3835	3844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009515	AAT	2	6	3861	3866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009515	ATA	2	6	4364	4369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009515	A	6	6	4369	4374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009515	ATT	2	6	4390	4395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009515	TAT	2	6	4977	4982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009515	TA	3	6	4985	4990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009515	GTT	2	6	5387	5392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009515	TTTA	2	8	5393	5400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009515	AT	3	6	5412	5417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009515	AAT	2	6	5418	5423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009515	T	6	6	5476	5481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009515	A	6	6	5482	5487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009515	A	7	7	5538	5544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009515	A	6	6	5550	5555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009515	TTAAAG	2	12	5946	5957	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009515	T	6	6	6010	6015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009515	T	6	6	6018	6023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009515	TGA	2	6	6042	6047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009515	TTTAAT	2	12	6067	6078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009515	TAA	2	6	6108	6113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009515	ATA	2	6	6124	6129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009515	T	6	6	7780	7785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009515	TA	4	8	7803	7810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009515	TAT	2	6	7824	7829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009515	AT	3	6	7828	7833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009515	ATA	2	6	7850	7855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009515	TTTAA	2	10	7871	7880	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009515	A	6	6	7908	7913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009515	A	6	6	7943	7948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009515	GGA	2	6	7963	7968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009515	AT	3	6	9114	9119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009515	TAA	2	6	9137	9142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009515	CAG	2	6	9194	9199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009515	ATT	2	6	9218	9223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009515	ATT	2	6	9232	9237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009515	T	6	6	9236	9241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009515	ATA	2	6	9264	9269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009515	ATA	2	6	9291	9296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009515	T	6	6	9297	9302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009515	ATTT	2	8	10144	10151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009515	T	7	7	10149	10155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009515	ATTAT	2	10	10156	10165	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009515	T	7	7	10168	10174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009515	ACT	2	6	10188	10193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009515	A	6	6	10196	10201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009515	GAA	2	6	10211	10216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009515	TAA	2	6	10221	10226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009515	TTTG	2	8	10233	10240	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009515	ATG	2	6	10241	10246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009515	T	6	6	10291	10296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009515	A	6	6	10308	10313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009515	TTAA	2	8	10328	10335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009515	ATTT	2	8	10425	10432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009515	TTTA	2	8	10459	10466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009515	TCAG	2	8	10471	10478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009515	ATA	2	6	10502	10507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009515	ATC	2	6	10544	10549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009515	AATT	2	8	10567	10574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009515	TTTC	2	8	10582	10589	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009515	TCA	2	6	10953	10958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009515	TA	3	6	10997	11002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009515	ATT	2	6	11042	11047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009515	AT	3	6	11054	11059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009515	ATT	2	6	11063	11068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009515	TTC	2	6	11386	11391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009515	A	6	6	11397	11402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009515	GTT	2	6	11975	11980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009515	T	7	7	12256	12262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009515	T	6	6	12266	12271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009515	T	7	7	12819	12825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009515	ATT	2	6	12828	12833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009515	CAT	2	6	12861	12866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009515	TAT	2	6	12867	12872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009515	TAA	2	6	12874	12879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009515	AT	4	8	12885	12892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009515	TTA	2	6	12893	12898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009515	TG	3	6	12911	12916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009515	GAA	2	6	12921	12926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009515	ACAT	2	8	12990	12997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009515	TGT	2	6	13011	13016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009515	ATTAT	2	10	13019	13028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009515	TAC	2	6	13046	13051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009515	A	6	6	13080	13085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009515	TAA	2	6	13275	13280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009515	TCA	2	6	13295	13300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009515	AAT	2	6	13326	13331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009515	ATT	2	6	13332	13337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009515	AATT	2	8	13681	13688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009515	TTAA	2	8	13713	13720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009515	GAA	2	6	13722	13727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009515	CAA	2	6	13768	13773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009515	T	6	6	13814	13819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009515	CATTA	2	10	13824	13833	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009515	T	6	6	13838	13843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009515	A	7	7	13877	13883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009515	TTA	2	6	13926	13931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009515	AAAT	2	8	13960	13967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009515	TCA	2	6	13972	13977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009515	TTTA	2	8	14000	14007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009515	TAA	2	6	14020	14025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009515	CAA	2	6	14035	14040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009515	CAA	2	6	14042	14047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009515	ATTA	2	8	14052	14059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009515	ATA	2	6	14062	14067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009515	ATA	3	9	14069	14077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009515	AAT	2	6	14078	14083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009515	TTTA	2	8	14094	14101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009515	AGG	2	6	14114	14119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009515	T	7	7	14960	14966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009515	ACT	2	6	15185	15190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_009515	T	8	8	15190	15197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009515	TTATTT	2	12	15257	15268	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009515	T	6	6	15271	15276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009515	T	6	6	15302	15307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009515	TAT	2	6	15314	15319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009515	T	6	6	16657	16662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_009515	TCC	2	6	102560	102565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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479	NC_009515	ATA	2	6	107535	107540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_009515	A	8	8	115210	115217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_009515	A	9	9	115724	115732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_009515	TA	3	6	119738	119743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_009515	AATT	2	8	119777	119784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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